Kit Henson var engang verdens førende knogleforsker, men nu står hun og hendes partner, Rufus, anklaget for mord og gravrøveri i Vietnam. Kit må bevise, at anklagerne mod hende er falske. Men hendes sind er mere skrøbeligt end før. Hun er langsomt ved at gøre sig selv så sindssyg, som hendes fjender ønsker det.
Alt det ændrer sig, da et sjak arbejdsmænd i Ecuador ved et tilfælde støder på en kvindelig mumie i en bjergslugt. Fundet sætter hele landet på den anden ende, fordi der går rygter om, at det kunne være liget af en inkaprinsesse, hvis fortabte hjerte skulle have overnaturlige kræfter.
Man sender bud efter Kit, som sammen med Rufus bliver hvirvlet ind i en hvepserede af politiske intriger. Alle vil have æren for at have fundet mumien, hvis hjerte hele landet er på udkig efter. Det siges, at hjertet indvarsler en ny, strålende tidsalder . ellers vil verden snart gå under i et frådende ildhav.
Jaguarens datter er en thriller, som følger inkaprinsessens bankende hjerte ind i det moderne Ecuadors dybeste afkroge for at finde grænsen mellem tro og overtro. Historien er andet bind i fortællingen om Kit Henson, men kan sagtens læses uafhængigt af Kejserens port, seriens første bind.
