En materia jurídica, se modificaron los derechos sobre el agua al solaparse con las nacientes necesidades agrícolas y los nuevos regímenes de tenencia de la tierra. Los molineros, trapicheros y dueños de batanes e ingenios que operaban debido a la dotación de mercedes reales se apoderaron de los derechos sobre el agua que requerían para mover su maquinaria. Ello ocasionó innumerables disputas legales entre los pueblos y los propietarios de aquellos sitios.