Найчастіше при обговоренні біологічних ритмів згадують такі гени і, відповідно, їхні білкові продукти: Clock (Circadian Locomotor Output Cycles Kaput), Bmal1 (Brain and Muscle ARNT-Like 1), Csnk1 (Casein kinase I isoform epsilon), Cry1,2 (Cryptochromes), Per1,2,3 (period circadian protein homolog), Chrono та деякі інші.